ШІ допоміг виявити «прихований» білок людини: він бере участь в обміні речовинами між клітинами
Науковці використали штучний інтелект для пошуку маловивчених білків людського організму та виявили незвичайну функцію білка TM184C. Виявилося, що він бере участь у формуванні мікроскопічних зв’язків, через які сусідні клітини можуть обмінюватися речовинами та навіть клітинними структурами.
Дослідження опубліковане в Nature. Автори вважають, що новий підхід може допомогти відкрити раніше невідомі механізми біології людини та краще досліджувати розвиток захворювань, зокрема раку.
ШІ порівняв понад 214 мільйонів білків
Дослідники із Sylvester Comprehensive Cancer Center при Університеті Маямі застосували ШІ не для порівняння генетичних послідовностей, а для пошуку подібності між тривимірними формами білків.
Система проаналізувала понад 214 мільйонів передбачених білкових структур і виявила маловивчені білки, форма яких нагадує рецептори родини GPCR.
Що виявили у білка TM184C
Особливу увагу науковців привернув TM184C. Експерименти показали, що він пов’язаний із тонкими структурами, які з’єднують сусідні клітини.
- через ці «містки» можуть переміщуватися внутрішньоклітинні пухирці;
- клітини здатні обмінюватися метаболітами та органелами;
- через з’єднання можуть переміщуватися навіть мітохондрії;
- TM184C також пов’язаний із регуляцією аутофагії — системи перероблення пошкоджених компонентів клітини.
Коли дослідники зменшували кількість TM184C, клітини утворювали менше таких з’єднань. Це вказує на безпосередню участь білка в організації міжклітинного обміну.
Чому відкриття важливе для дослідження раку
Подібний обмін може допомагати клітинам переживати стрес. Для пухлинних клітин, яким часто бракує кисню та поживних речовин, такі зв’язки потенційно можуть бути додатковим механізмом виживання.
Дослідження в Nature не означає, що науковці вже знайшли новий метод лікування раку. Однак воно демонструє, що аналіз тривимірної структури білків за допомогою ШІ може виявляти біологічні механізми, які складно знайти традиційним аналізом генетичних послідовностей.
